Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 HERC2P9-203ENST00000528584 2947 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 NLGN3-205ENST00000536169 3863 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 AL022238.4-201ENST00000639722 4563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 P4HA1-201ENST00000263556 2844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 P4HA1-204ENST00000394890 2844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 PLCG2-207ENST00000564138 8707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 SRRM5-201ENST00000417606 2381 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 ALOXE3-201ENST00000318227 3053 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 ERBB2-219ENST00000584601 4792 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 SLC8B1-213ENST00000552014 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 MADD-206ENST00000402192 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 UNC45B-201ENST00000268876 5679 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 MSH6-215ENST00000622629 4324 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 ILF3-202ENST00000407004 3671 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 COL11A1-203ENST00000370096 7286 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 ATP11A-212ENST00000487903 8858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 NLRX1-214ENST00000525863 2850 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 TIFAB-201ENST00000537858 5923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 MAP7-208ENST00000617204 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 NKTR-201ENST00000232978 7343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 SLC25A25-AS1-201ENST00000418747 6391 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 ARHGAP32-206ENST00000527272 5289 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 AL359641.1-201ENST00000412509 1558 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 SEPT10-202ENST00000397712 3071 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 RIMS2-207ENST00000504942 4228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 CR2-203ENST00000367059 3877 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 CEP41-201ENST00000223208 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 PKP4P1-201ENST00000426801 2158 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 LPIN2-201ENST00000261596 6229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 IDS-201ENST00000340855 7619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 MYO7B-202ENST00000409816 6694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 RGS3-207ENST00000374140 4591 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 PAK1-215ENST00000530617 3001 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 SLC13A2-202ENST00000444914 2855 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 ROBO4-208ENST00000533054 3071 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 AL162391.1-201ENST00000419853 2102 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
TMEM258P61165 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms