Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPHB3P54753 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPHB3P54753 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms