Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMARCA2P51531 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms