Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERFP50548 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERFP50548 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERFP50548 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms