Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NESP48681 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NESP48681 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NESP48681 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NESP48681 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NESP48681 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NESP48681 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NESP48681 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NESP48681 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NESP48681 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NESP48681 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NESP48681 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NESP48681 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NESP48681 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NESP48681 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NESP48681 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NESP48681 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NESP48681 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NESP48681 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NESP48681 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NESP48681 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NESP48681 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NESP48681 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NESP48681 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NESP48681 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NESP48681 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NESP48681 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NESP48681 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NESP48681 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NESP48681 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NESP48681 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NESP48681 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NESP48681 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NESP48681 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NESP48681 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NESP48681 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NESP48681 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NESP48681 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NESP48681 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NESP48681 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NESP48681 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NESP48681 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NESP48681 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NESP48681 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NESP48681 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NESP48681 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NESP48681 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NESP48681 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NESP48681 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NESP48681 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NESP48681 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NESP48681 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NESP48681 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NESP48681 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NESP48681 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NESP48681 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NESP48681 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NESP48681 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NESP48681 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NESP48681 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NESP48681 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NESP48681 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NESP48681 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NESP48681 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NESP48681 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NESP48681 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NESP48681 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NESP48681 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NESP48681 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NESP48681 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NESP48681 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NESP48681 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NESP48681 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NESP48681 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NESP48681 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NESP48681 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NESP48681 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NESP48681 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NESP48681 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NESP48681 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NESP48681 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NESP48681 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NESP48681 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NESP48681 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NESP48681 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NESP48681 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NESP48681 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NESP48681 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NESP48681 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NESP48681 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NESP48681 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NESP48681 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NESP48681 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NESP48681 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NESP48681 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NESP48681 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NESP48681 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NESP48681 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NESP48681 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NESP48681 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms