Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LTBRP36941 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LTBRP36941 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
LTBRP36941 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBRP36941 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBRP36941 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBRP36941 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBRP36941 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBRP36941 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBRP36941 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBRP36941 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBRP36941 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBRP36941 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBRP36941 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBRP36941 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBRP36941 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBRP36941 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBRP36941 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBRP36941 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBRP36941 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBRP36941 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBRP36941 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBRP36941 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBRP36941 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBRP36941 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBRP36941 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBRP36941 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBRP36941 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBRP36941 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBRP36941 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBRP36941 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBRP36941 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBRP36941 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBRP36941 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LTBRP36941 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBRP36941 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBRP36941 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBRP36941 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBRP36941 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBRP36941 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBRP36941 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBRP36941 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBRP36941 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBRP36941 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LTBRP36941 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms