Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC13P31276 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms