Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXA13P31271 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms