Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms