Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP1P29466 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP1P29466 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP1P29466 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP1P29466 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP1P29466 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP1P29466 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP1P29466 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP1P29466 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP1P29466 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP1P29466 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP1P29466 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP1P29466 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP1P29466 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP1P29466 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP1P29466 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP1P29466 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP1P29466 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP1P29466 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP1P29466 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP1P29466 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP1P29466 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP1P29466 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP1P29466 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP1P29466 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP1P29466 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP1P29466 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP1P29466 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP1P29466 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP1P29466 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP1P29466 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP1P29466 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP1P29466 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP1P29466 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP1P29466 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP1P29466 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP1P29466 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms