Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PSMB5P28074 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PSMB5P28074 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms