Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PLNP26678 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PLNP26678 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms