Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms