Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNCP24863 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNCP24863 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNCP24863 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNCP24863 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNCP24863 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNCP24863 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNCP24863 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNCP24863 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNCP24863 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNCP24863 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNCP24863 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNCP24863 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNCP24863 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNCP24863 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNCP24863 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNCP24863 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNCP24863 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNCP24863 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNCP24863 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNCP24863 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCNCP24863 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCNCP24863 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNCP24863 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNCP24863 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNCP24863 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNCP24863 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNCP24863 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNCP24863 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNCP24863 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNCP24863 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNCP24863 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNCP24863 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNCP24863 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNCP24863 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNCP24863 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNCP24863 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNCP24863 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNCP24863 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNCP24863 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNCP24863 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNCP24863 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNCP24863 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCNCP24863 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms