Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRHP20396 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRHP20396 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRHP20396 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRHP20396 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRHP20396 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRHP20396 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRHP20396 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRHP20396 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRHP20396 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRHP20396 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRHP20396 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRHP20396 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRHP20396 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRHP20396 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRHP20396 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRHP20396 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRHP20396 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRHP20396 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRHP20396 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRHP20396 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRHP20396 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRHP20396 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRHP20396 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRHP20396 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRHP20396 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRHP20396 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRHP20396 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRHP20396 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRHP20396 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRHP20396 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRHP20396 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRHP20396 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRHP20396 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRHP20396 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRHP20396 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TRHP20396 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 TSGA13-201ENST00000356588 1372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 AC022121.1-201ENST00000484584 579 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRHP20396 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRHP20396 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRHP20396 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRHP20396 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRHP20396 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRHP20396 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRHP20396 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRHP20396 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRHP20396 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRHP20396 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRHP20396 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRHP20396 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRHP20396 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRHP20396 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRHP20396 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRHP20396 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRHP20396 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRHP20396 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRHP20396 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRHP20396 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRHP20396 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRHP20396 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms