Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCNA2P20248 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms