Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VCLP18206 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VCLP18206 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VCLP18206 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VCLP18206 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VCLP18206 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms