Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPN1P18031 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms