Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms