Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA4P13612 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms