Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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