Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CREB3O43889 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB3O43889 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB3O43889 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB3O43889 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB3O43889 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB3O43889 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB3O43889 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB3O43889 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB3O43889 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB3O43889 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB3O43889 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB3O43889 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB3O43889 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB3O43889 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB3O43889 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB3O43889 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB3O43889 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB3O43889 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB3O43889 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB3O43889 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB3O43889 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB3O43889 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB3O43889 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB3O43889 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB3O43889 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB3O43889 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB3O43889 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB3O43889 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB3O43889 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB3O43889 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB3O43889 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB3O43889 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB3O43889 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CREB3O43889 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB3O43889 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB3O43889 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB3O43889 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB3O43889 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB3O43889 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CREB3O43889 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms