Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

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Length 550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COCHO43405 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COCHO43405 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COCHO43405 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COCHO43405 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COCHO43405 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COCHO43405 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COCHO43405 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COCHO43405 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COCHO43405 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COCHO43405 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COCHO43405 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COCHO43405 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COCHO43405 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COCHO43405 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COCHO43405 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COCHO43405 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COCHO43405 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COCHO43405 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COCHO43405 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COCHO43405 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COCHO43405 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COCHO43405 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COCHO43405 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COCHO43405 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COCHO43405 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COCHO43405 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COCHO43405 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COCHO43405 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COCHO43405 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
COCHO43405 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COCHO43405 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COCHO43405 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COCHO43405 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COCHO43405 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COCHO43405 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COCHO43405 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COCHO43405 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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