Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSI1O43347 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSI1O43347 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSI1O43347 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSI1O43347 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSI1O43347 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSI1O43347 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSI1O43347 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSI1O43347 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSI1O43347 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSI1O43347 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSI1O43347 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSI1O43347 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSI1O43347 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSI1O43347 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MSI1O43347 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSI1O43347 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MSI1O43347 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSI1O43347 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSI1O43347 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSI1O43347 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSI1O43347 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSI1O43347 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSI1O43347 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSI1O43347 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSI1O43347 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSI1O43347 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSI1O43347 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSI1O43347 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSI1O43347 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSI1O43347 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MSI1O43347 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSI1O43347 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSI1O43347 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSI1O43347 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSI1O43347 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSI1O43347 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSI1O43347 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSI1O43347 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSI1O43347 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSI1O43347 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MSI1O43347 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSI1O43347 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSI1O43347 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSI1O43347 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSI1O43347 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSI1O43347 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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MSI1O43347 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSI1O43347 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSI1O43347 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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MSI1O43347 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MSI1O43347 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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MSI1O43347 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSI1O43347 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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MSI1O43347 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSI1O43347 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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MSI1O43347 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSI1O43347 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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MSI1O43347 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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MSI1O43347 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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MSI1O43347 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSI1O43347 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSI1O43347 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MSI1O43347 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSI1O43347 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSI1O43347 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSI1O43347 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSI1O43347 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSI1O43347 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MSI1O43347 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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