Protein–RNA interactions for Protein: O43175

PHGDH, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGDHO43175 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHGDHO43175 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHGDHO43175 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms