Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TXNDC9O14530 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms