Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms