Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEDD8-MDP1E9PL57 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NEDD8-MDP1E9PL57 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms