Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms