Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E9PBE3 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E9PBE3 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E9PBE3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E9PBE3 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E9PBE3 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E9PBE3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E9PBE3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E9PBE3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E9PBE3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E9PBE3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E9PBE3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E9PBE3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E9PBE3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
E9PBE3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
E9PBE3 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E9PBE3 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E9PBE3 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E9PBE3 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E9PBE3 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E9PBE3 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E9PBE3 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E9PBE3 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E9PBE3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
E9PBE3 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E9PBE3 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E9PBE3 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
E9PBE3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E9PBE3 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E9PBE3 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
E9PBE3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
E9PBE3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E9PBE3 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E9PBE3 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms