Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PATL2C9JE40 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms