Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC162PA2VCL2 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms