Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SNX13Q9Y5W8 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SNX13Q9Y5W8 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SNX13Q9Y5W8 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SNX13Q9Y5W8 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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SNX13Q9Y5W8 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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