Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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SH3BP1Q9Y3L3 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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SH3BP1Q9Y3L3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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SH3BP1Q9Y3L3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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SH3BP1Q9Y3L3 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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