Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CIZ1Q9ULV3 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms