Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRPF3Q9ULD4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms