Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYTH4Q9UIA0 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms