Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COPG2Q9UBF2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms