Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD5Q9P267 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms