Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y5

CAMSAP3, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP3Q9P1Y5 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CAMSAP3Q9P1Y5 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms