Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00597Q9H2U6 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms