Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM8Q9BZR9 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms