Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms