Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms