Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 LINC00893-215ENST00000618757 2347 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 IL1RAP-211ENST00000439062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms