Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERPUD2Q9BSE4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms