Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms