Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLF1Q9BQI6 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms