Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

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Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PKP4Q99569 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PKP4Q99569 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PKP4Q99569 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PKP4Q99569 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PKP4Q99569 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKP4Q99569 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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