Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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